Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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