Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD1Q9UIS9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms