Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CYTH4Q9UIA0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms