Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms