Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms