Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4Q9P0V3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4Q9P0V3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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