Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A4Q9NY91 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A4Q9NY91 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A4Q9NY91 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A4Q9NY91 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A4Q9NY91 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A4Q9NY91 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A4Q9NY91 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A4Q9NY91 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A4Q9NY91 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms