Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED17Q9NVC6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED17Q9NVC6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED17Q9NVC6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED17Q9NVC6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED17Q9NVC6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED17Q9NVC6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED17Q9NVC6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED17Q9NVC6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED17Q9NVC6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED17Q9NVC6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms