Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms