Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms