Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms