Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS45Q9NRW7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms