Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms