Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.92■■■□□ 2.382e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-229ENST00000534456 587 ntTSL 429.59■■■□□ 2.332e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.312e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.32e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.282e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-218ENST00000496053 694 ntTSL 328.51■■■□□ 2.162e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 SNRNP70-207ENST00000598984 547 ntTSL 528.44■■■□□ 2.141e-11■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.092e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-221ENST00000497847 1031 ntTSL 228.06■■■□□ 2.082e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-215ENST00000483791 681 ntTSL 328.06■■■□□ 2.082e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.042e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 DOLPP1-201ENST00000327812 1932 ntTSL 1 (best)27.6■■■□□ 2.012e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LRRC4B-203ENST00000600381 853 ntTSL 227.55■■■□□ 22e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 22e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.992e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.962e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 NAA50-205ENST00000481432 958 ntTSL 327.26■■□□□ 1.952e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 NAA50-204ENST00000478020 473 ntTSL 427.26■■□□□ 1.952e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 NAA50-202ENST00000467022 520 ntTSL 427.26■■□□□ 1.952e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.952e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.942e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LPAR2-207ENST00000590629 595 ntTSL 327.08■■□□□ 1.932e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-222ENST00000528141 576 ntTSL 426.68■■□□□ 1.862e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.862e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.832e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LBH-207ENST00000464412 494 ntTSL 426.46■■□□□ 1.832e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 MAN2C1-234ENST00000566634 1540 ntTSL 526.25■■□□□ 1.792e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 KLHL21-205ENST00000496707 824 ntTSL 1 (best)26.23■■□□□ 1.792e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 DOLPP1-204ENST00000412363 911 ntTSL 525.69■■□□□ 1.72e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.662e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 RNASEH2A-204ENST00000593017 1487 ntTSL 225.02■■□□□ 1.62e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.582e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.575e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.572e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 RNASEH2A-205ENST00000639767 647 ntTSL 524.77■■□□□ 1.562e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.432e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.382e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.362e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 MAN2C1-208ENST00000562461 591 ntTSL 423.14■■□□□ 1.32e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 F11R-205ENST00000602966 558 ntTSL 423.04■■□□□ 1.282e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 F11R-201ENST00000335772 571 ntTSL 423.04■■□□□ 1.282e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.232e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.192e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.182e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LBH-206ENST00000412933 550 ntTSL 422.17■■□□□ 1.142e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CHFR-202ENST00000315585 2446 ntTSL 221.77■■□□□ 1.082e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-208ENST00000474831 564 ntTSL 321.33■■□□□ 12e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 GALNT2-205ENST00000494106 692 ntTSL 521.11■□□□□ 0.972e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.972e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.972e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FBXO3-211ENST00000532927 945 ntTSL 220.87■□□□□ 0.932e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 KBTBD2-207ENST00000485611 537 ntTSL 420.8■□□□□ 0.925e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 KBTBD2-204ENST00000452926 537 ntTSL 420.8■□□□□ 0.925e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 MAN2C1-207ENST00000562228 734 ntTSL 320.77■□□□□ 0.922e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.882e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.852e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-230ENST00000534660 552 ntTSL 320.34■□□□□ 0.852e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 420.01■□□□□ 0.792e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FBXO3-206ENST00000529137 584 ntTSL 518.26■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C14orf2-208ENST00000554713 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CDK17-202ENST00000542666 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FBXO3-202ENST00000448981 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.442e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CHFR-220ENST00000541817 758 ntTSL 516.41■□□□□ 0.222e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CDK17-210ENST00000552262 566 ntTSL 316.3■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C1QBP-202ENST00000570805 688 ntTSL 315.77■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C14orf2-210ENST00000555030 749 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C14orf2-212ENST00000557260 856 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FYTTD1-204ENST00000418169 593 ntTSL 515.46■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FBXO3-201ENST00000265651 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 NAA50-210ENST00000616174 3257 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LINC00854-214ENST00000615433 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.69□□□□□ -0.064e-8■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.164e-8■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C14orf2-201ENST00000286953 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FYTTD1-203ENST00000415708 1342 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 SNRNP70-208ENST00000599687 563 ntTSL 213.29□□□□□ -0.281e-11■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 KBTBD2-203ENST00000424468 593 ntTSL 413.09□□□□□ -0.315e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FBXO3-207ENST00000530013 3740 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C14orf2-207ENST00000554528 526 ntTSL 212.84□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C14orf2-203ENST00000553430 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CDK17-211ENST00000552496 583 ntTSL 312.73□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C14orf2-204ENST00000553449 271 ntTSL 212.6□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C14orf2-205ENST00000554089 932 ntTSL 1 (best)12.59□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 VAT1-209ENST00000592388 478 ntTSL 512.37□□□□□ -0.432e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 17.8
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