Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms