Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf4Q9NR00 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms