Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms