Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6CQ9HCJ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms