Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms