Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP29Q9HBJ7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms