Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms