Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG4

ATP6V0A4, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0A4Q9HBG4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0A4Q9HBG4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0A4Q9HBG4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms