Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms