Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKRIP1Q9H875 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms