Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N1

TMX1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1Q9H3N1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX1Q9H3N1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX1Q9H3N1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms