Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms