Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMBRA1Q9C0C7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms