Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms