Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROPN1BQ9BZX4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms