Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms