Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms