Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms