Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FYCO1Q9BQS8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms