Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYD88Q99836 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms