Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAP1L3Q99457 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAP1L3Q99457 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms