Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YME1L1Q96TA2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YME1L1Q96TA2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms