Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms