Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms