Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR3Q96KR7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms