Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD4Q96KN9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD4Q96KN9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms