Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS50Q96JG6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms