Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms