Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHDQ96IW2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms