Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF496Q96IT1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF496Q96IT1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms