Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LTV1Q96GA3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms