Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CMTM5Q96DZ9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms