Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EAF2Q96CJ1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EAF2Q96CJ1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms