Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PHF20L1-204ENST00000361997 3237 ntTSL 512.43□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SART3-206ENST00000546815 2318 ntTSL 512.41□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 OIP5-AS1-204ENST00000558457 676 ntTSL 212.41□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LONP2-202ENST00000416006 2056 ntTSL 212.4□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCDC51-203ENST00000438370 556 ntTSL 312.38□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM168-203ENST00000441474 570 ntTSL 412.37□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LPIN1-219ENST00000495907 578 ntTSL 412.37□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAF1-205ENST00000595797 760 ntTSL 312.36□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 METTL22-218ENST00000572956 706 ntTSL 312.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 METTL22-214ENST00000565866 561 ntTSL 312.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 C12orf76-206ENST00000548936 562 ntTSL 412.33□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-222ENST00000512014 688 ntTSL 312.33□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RNF4-206ENST00000504782 614 ntTSL 212.33□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NRP1-206ENST00000374867 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NIT2-203ENST00000465368 1469 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CSK-214ENST00000569915 578 ntTSL 412.32□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CORO7-208ENST00000571227 3578 ntTSL 512.3□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 WWC2-205ENST00000504005 5247 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPHLN1-216ENST00000551406 648 ntTSL 212.27□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHYKPL-203ENST00000393488 1001 ntTSL 312.27□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AKTIP-209ENST00000566045 554 ntTSL 212.26□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EMC1-201ENST00000375199 5408 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-214ENST00000527927 850 ntTSL 512.24□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PRDM16-205ENST00000509860 3737 ntTSL 512.24□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TGFBR3-211ENST00000533370 563 ntTSL 412.23□□□□□ -0.455e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAD52-209ENST00000488642 2413 ntTSL 212.23□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RABGAP1-203ENST00000402311 543 ntTSL 412.22□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LARGE1-215ENST00000609799 581 ntTSL 512.22□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM14B-211ENST00000473807 559 ntTSL 412.21□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ATP5C1-205ENST00000462760 573 ntTSL 212.21□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SMIM14-202ENST00000505729 612 ntTSL 412.21□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXI1-206ENST00000442296 634 ntTSL 512.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENO1-206ENST00000497492 647 ntTSL 212.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BRMS1L-205ENST00000552677 1544 ntTSL 212.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CENPO-206ENST00000473706 4272 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RPH3AL-210ENST00000573448 487 ntTSL 512.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AC007277.1-201ENST00000428156 2189 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.465e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMBIM1-223ENST00000495113 596 ntTSL 212.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AL390719.1-206ENST00000451054 565 ntTSL 212.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMBIM1-206ENST00000425694 569 ntTSL 212.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LDLRAP1-207ENST00000488127 4670 ntTSL 212.16□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMBIM1-210ENST00000439306 631 ntTSL 512.15□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ACACA-234ENST00000614482 2177 ntTSL 212.14□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDUFA10-207ENST00000443626 776 ntTSL 512.13□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMBIM1-207ENST00000429501 677 ntTSL 512.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SHROOM2-202ENST00000418909 4615 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EPHB4-202ENST00000360620 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB37-212ENST00000528438 1494 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMBIM1-220ENST00000466012 572 ntTSL 512.07□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHYKPL-208ENST00000481811 2709 ntTSL 212.02□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HDLBP-234ENST00000471294 490 ntTSL 412.02□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HDLBP-215ENST00000427487 924 ntTSL 512.02□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TTLL5-202ENST00000298832 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB37-213ENST00000531420 561 ntTSL 411.98□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EMC1-212ENST00000494770 779 ntTSL 511.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 STAM-203ENST00000445846 740 ntTSL 411.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EPS15L1-209ENST00000596037 629 ntTSL 311.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DDC-203ENST00000420203 460 ntTSL 211.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SETD3-205ENST00000446066 1754 ntTSL 511.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLS1-208ENST00000483373 608 ntTSL 511.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MON1B-207ENST00000566455 2864 ntTSL 211.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MRPS28-202ENST00000518271 487 ntTSL 511.86□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM14B-213ENST00000478732 344 ntTSL 511.86□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 54.9
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 319 ms