Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPF3Q92784 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms