Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms